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Clinical outcome upon infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ranges from silent infection to lethal coronavirus disease 2019 (COVID-19). We have found an enrichment in rare variants predicted to be loss-of-function (LOF) at the 13 human loci known to govern Toll-like receptor 3 (TLR3)- and interferon regulatory factor 7 (IRF7)-dependent type I interferon (IFN) immunity to influenza virus in 659 patients with life-threatening COVID-19 pneumonia relative to 534 subjects with asymptomatic or benign infection. By testing these and other rare variants at these 13 loci, we experimentally defined LOF variants underlying autosomal-recessive or autosomal-dominant deficiencies in 23 patients (3.5%) 17 to 77 years of age. We show that human fibroblasts with mutations affecting this circuit are vulnerable to SARS-CoV-2. Inborn errors of TLR3- and IRF7-dependent type I IFN immunity can underlie life-threatening COVID-19 pneumonia in patients with no prior severe infection.
Zhang, Q., Liu, Z., Moncada-Velez, M., Chen, J., Ogishi, M., Bigio, B., et al. (2020). Inborn errors of type I IFN immunity in patients with life-threatening COVID-19. SCIENCE, 370(6515) [10.1126/science.abd4570].
Inborn errors of type I IFN immunity in patients with life-threatening COVID-19
Zhang, Q.;Liu, Z.;Moncada-Velez, M.;Chen, J.;Ogishi, M.;Bigio, B.;Yang, R.;Arias, A. A.;Zhou, Q.;Han, J. E.;Ugurbil, A. C.;Zhang, P.;Rapaport, F.;Li, J.;Spaan, A. N.;Boisson, B.;Boisson-Dupuis, S.;Bustamante, J.;Puel, A.;Ciancanelli, M. J.;Zhang, S. -Y.;Béziat, V.;Jouanguy, E.;Abel, L.;Cobat, A.;Casanova, J. -L.;Bastard, P.;Korol, C.;Rosain, J.;Philippot, Q.;Chbihi, M.;Lorenzo, L.;Bizien, L.;Neehus, A. -L.;Kerner, G.;Seeleuthner, Y.;Manry, J.;Le Voyer, T.;Boisson, B.;Boisson-Dupuis, S.;Bustamante, J.;Puel, A.;Zhang, S. -Y.;Béziat, V.;Jouanguy, E.;Abel, L.;Cobat, A.;Bastard, P.;Rosain, J.;Philippot, Q.;Chbihi, M.;Lorenzo, L.;Bizien, L.;Neehus, A. -L.;Kerner, G.;Seeleuthner, Y.;Manry, J.;Le Voyer, T.;Boisson, B.;Boisson-Dupuis, S.;Bustamante, J.;Puel, A.;Zhang, S. -Y.;Béziat, V.;Jouanguy, E.;Abel, L.;Cobat, A.;Le Pen, J.;Schneider, W. M.;Razooky, B. S.;Hoffmann, H. -H.;Michailidis, E.;Rice, C. M.;Sabli, I. K. 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2020-01-01
Abstract
Clinical outcome upon infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ranges from silent infection to lethal coronavirus disease 2019 (COVID-19). We have found an enrichment in rare variants predicted to be loss-of-function (LOF) at the 13 human loci known to govern Toll-like receptor 3 (TLR3)- and interferon regulatory factor 7 (IRF7)-dependent type I interferon (IFN) immunity to influenza virus in 659 patients with life-threatening COVID-19 pneumonia relative to 534 subjects with asymptomatic or benign infection. By testing these and other rare variants at these 13 loci, we experimentally defined LOF variants underlying autosomal-recessive or autosomal-dominant deficiencies in 23 patients (3.5%) 17 to 77 years of age. We show that human fibroblasts with mutations affecting this circuit are vulnerable to SARS-CoV-2. Inborn errors of TLR3- and IRF7-dependent type I IFN immunity can underlie life-threatening COVID-19 pneumonia in patients with no prior severe infection.
Zhang, Q., Liu, Z., Moncada-Velez, M., Chen, J., Ogishi, M., Bigio, B., et al. (2020). Inborn errors of type I IFN immunity in patients with life-threatening COVID-19. SCIENCE, 370(6515) [10.1126/science.abd4570].
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.