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Unlike for classes A and B, a standardized amino acid numbering scheme has not been proposed for the class C (AmpC) β-lactamases, which complicates communication in the field. Here, we propose a scheme developed through a collaborative approach that considers both sequence and structure, preserves traditional numbering of catalytically important residues (Ser64, Lys67, Tyr150, and Lys315), is adaptable to new variants or enzymes yet to be discovered and includes a variation for genetic and epidemiological applications.
Mack, A.R., Barnes, M.D., Taracila, M.A., Hujer, A.M., Hujer, K.M., Cabot, G., et al. (2020). A standard numbering scheme for class C β-lactamases. ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, 64(3) [10.1128/AAC.01841-19].
A standard numbering scheme for class C β-lactamases
Mack A. R.;Barnes M. D.;Taracila M. A.;Hujer A. M.;Hujer K. M.;Cabot G.;Feldgarden M.;Haft D. H.;Klimke W.;Van Den Akker F.;Vila A. J.;Smania A.;Haider S.;Papp-Wallace K. M.;Bradford P. A.;Rossolini G. M.;Docquier J. D.;Frere J. -M.;Galleni M.;Hanson N. D.;Oliver A.;Plesiat P.;Poirel L.;Nordmann P.;Palzkill T. G.;Jacoby G. A.;Bush K.;Bonomo R. A.
2020-01-01
Abstract
Unlike for classes A and B, a standardized amino acid numbering scheme has not been proposed for the class C (AmpC) β-lactamases, which complicates communication in the field. Here, we propose a scheme developed through a collaborative approach that considers both sequence and structure, preserves traditional numbering of catalytically important residues (Ser64, Lys67, Tyr150, and Lys315), is adaptable to new variants or enzymes yet to be discovered and includes a variation for genetic and epidemiological applications.
Mack, A.R., Barnes, M.D., Taracila, M.A., Hujer, A.M., Hujer, K.M., Cabot, G., et al. (2020). A standard numbering scheme for class C β-lactamases. ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, 64(3) [10.1128/AAC.01841-19].
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11365/1125159
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
